Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkn3Q8K045 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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