Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SbsnQ8CIT9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SbsnQ8CIT9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbsnQ8CIT9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SbsnQ8CIT9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SbsnQ8CIT9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms