Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NgefQ8CHT1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NgefQ8CHT1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NgefQ8CHT1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms