Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms