Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tcerg1Q8CGF7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms