Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdc34Q8CFI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc34Q8CFI2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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