Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9030612E09RikQ8CE20 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms