Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc17Q8CE13 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms