Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph6aQ8CDR2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph6aQ8CDR2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms