Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phf20l1Q8CCJ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf20l1Q8CCJ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms