Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufl1Q8CCJ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms