Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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