Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E4f1Q8CCE9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms