Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf170Q8CBG9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf170Q8CBG9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf170Q8CBG9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnf170Q8CBG9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf170Q8CBG9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf170Q8CBG9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf170Q8CBG9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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