Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn3Q8CBC6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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