Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms