Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms