Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr2Q8C8T8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms