Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx16Q8C080 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Snx16Q8C080 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx16Q8C080 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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