Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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Usp47Q8BY87 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Usp47Q8BY87 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp47Q8BY87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
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Usp47Q8BY87 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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Usp47Q8BY87 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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Usp47Q8BY87 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp47Q8BY87 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
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