Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms