Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube3dQ8BX13 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms