Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PcgF3Q8BTQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms