Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rd3Q8BRE0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rd3Q8BRE0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3Q8BRE0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3Q8BRE0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms