Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPQ7

Sgsm1, Small G protein signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm1Q8BPQ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgsm1Q8BPQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgsm1Q8BPQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms