Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga3Q8BMI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms