Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hirip3Q8BLH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms