Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms