Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan12Q8BKT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms