Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms