Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms