Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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