Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdspl2Q8BG15 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdspl2Q8BG15 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms