Protein–RNA interactions for Protein: Q810Y9

Pramel6, PRAMEl6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel6Q810Y9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramel6Q810Y9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel6Q810Y9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms