Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc172Q810N9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms