Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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