Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp8Q80YR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms