Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pip4k2bQ80XI4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pip4k2bQ80XI4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms