Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clasp1Q80TV8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Clasp1Q80TV8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clasp1Q80TV8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms