Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ube2q1Q7TSS2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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