Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms