Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms