Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpf1Q7TND5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms