Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed3Q78IS1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms