Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms