Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd4Q6ZPR5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms