Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LcorQ6ZPI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms