Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms