Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9c1Q6UJY2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms