Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms